Khi người mua sắm trực tuyến tăng lên, các tùy chọn thanh toán của họ cũng tăng theo. Theo một bài báo năm 2015 của Gallup, 35% người Mỹ trưởng thành cho biết họ mua sắm trực tuyến nhiều hơn năm trước. Các phương thức thanh toán trực tuyến bao gồm từ nhập biểu mẫu thẻ tín dụng truyền thống đến các ứng dụng di động cho các dịch vụ ngang hàng như Paypal, Popmoney và Dwolla.
Bất chấp sự phổ biến ngày càng tăng của Paypal, việc nhập thủ công thông tin thẻ tín dụng sang dạng kỹ thuật số vẫn là cách chính mà người tiêu dùng thực hiện thanh toán trực tuyến. Thẻ tín dụng, được hỗ trợ bởi các ngân hàng và luật liên bang, bảo vệ người tiêu dùng, hạn chế trách nhiệm pháp lý của bạn trong trường hợp mua hàng trái phép. Visa USA và MasterCard International cũng mở rộng chính sách "không chịu trách nhiệm pháp lý" đối với các giao dịch thẻ ghi nợ trái phép trên mạng của họ. Thẻ ghi nợ trả trước có biểu tượng Visa hoặc MasterCard có thể được sử dụng để thực hiện thanh toán trực tuyến giống như thẻ do ngân hàng phát hành. Tuy nhiên, phí sử dụng có thể được áp dụng.
Hệ thống thanh toán ngang hàng, còn được gọi là giữa người với người hoặc P2P, cho phép người tiêu dùng thanh toán trực tiếp cho các cá nhân, doanh nghiệp và tổ chức. Paypal, thuộc sở hữu của Ebay, dẫn đầu danh mục này. Tuy nhiên, ngày càng có nhiều công ty như Dwolla, Google Wallet và Popmoney cung cấp các dịch vụ tương tự. Wells Fargo, Bank of America và JPMorgan Chase đã hợp tác để cung cấp dịch vụ P2P của riêng họ, ClearXchange. Rủi ro khi sử dụng các dịch vụ này phụ thuộc vào phương thức thanh toán được liên kết với tài khoản ngang hàng của bạn. Nếu tài khoản Paypal của bạn được liên kết với thẻ tín dụng, các giao dịch mua của bạn được bảo vệ bởi tất cả các biện pháp bảo vệ thẻ tín dụng.
Các cơ quan chính phủ từ lâu đã sử dụng hệ thống thanh toán Nhà bù trừ tự động để thu thập và phân bổ ngân quỹ. Nó cũng được sử dụng bởi các nhà tuyển dụng để phân phối bảng lương thông qua hình thức gửi tiền trực tiếp. Người tiêu dùng chủ yếu sử dụng ACH để thanh toán các hóa đơn thế chấp, điện nước hoặc học phí. Với ACH, khách hàng nhập số tài khoản séc và số bộ định tuyến ngân hàng vào một biểu mẫu trực tuyến. Được các ngân hàng coi là séc điện tử, các giao dịch ACH có thể được ủy quyền để thanh toán một lần hoặc định kỳ. Một số ngân hàng tính một khoản phí nhỏ để sử dụng phương thức thanh toán này.
Chuyển khoản ngân hàng, trong đó tiền được trao đổi từ tổ chức tài chính này sang tổ chức tài chính khác, là một cách an toàn để thực hiện các giao dịch mua lớn trực tuyến. Một số thẻ tín dụng và thẻ ghi nợ và các dịch vụ ngang hàng áp đặt giới hạn số tiền mua hàng. Có thể thực hiện các giao dịch quan trọng, chẳng hạn như trả trước một căn nhà, mua xe hơi hoặc thanh toán học phí bằng chuyển khoản ngân hàng. Điều này giúp loại bỏ các lo ngại về bảo mật, chẳng hạn như xử lý một lượng lớn tiền mặt hoặc mang theo séc của thủ quỹ. Các ngân hàng đã từng yêu cầu khách hàng yêu cầu trực tiếp bằng văn bản về chuyển khoản ngân hàng. Giờ đây, nhiều ngân hàng hơn cho phép người tiêu dùng thuận tiện khi thực hiện các giao dịch này trực tuyến.